Compartimentul a fost infiintat in anul 1991 in cadrul Blocului operator chirurgie in urma donatiei de echipament endoscopic al Organizatiei CARITAS Austria, prin eforturile dr. Dan Catana
In perioada 1998-2003 compartimentul a functionat in cadrul sectiei pediatrie II
Incepand din anul 2004 compartimentul functioneaza independent
În 1999, graţie unei sponsorizări provenite din partea Băncii Mondiale, se achiziţionează 6 linii Pentax pentru endoscopie digestivă, superioară şi inferioară. Între 1999 – 2005 s-au efectuat în acest compartiment aproximativ 2700 endoscopii superioare şi 300 endoscopii inferioare.
Laboratorul de Motilitate Digestivă
Tot din anul 1999 s-a dezvoltat şi Laboratorul de Motilitate Digestivă unde se efectuează studii de pH-metrie esofagiană (aproximativ 600 proceduri efectuate între 1999 – 2005)
Proceduri ce se efectuează în cadrul Compartimentului de Endoscopie Digestivă:
–endoscopie digestivă superioară şi inferioară
–dilataţii esofagiene
–extragere de corpi străini din tractul esofagian
–sclerozare de varice esofagiene
–polipectomie endoscopică
–gastrostomă endoscopică
–biopsie intestinală