În cadrul Spitalului Clinic Colentina funcţionează secţii, compartimente, cabinete, servicii şi laboratoare repartizate în următoarele pavilioane:
În pavilionul B (fost Dermatologie) funcţionează: alergologie şi imunologie (compartimentul de alergologie şi imunologie clinică)
boli parazitare (secţia de boli parazitare "parazitologie") dermato-venerologie (secţia 1 de dermatologie) dermato-venerologie (secţia 2 de dermatologie) hematologie (secţia de hematologie - oncologie) medicină internă (secţia 2 de medicină internă) medicină internă (secţia 3 de medicină internă) recuperare medicală (secţia de recuperare medicală)
reumatologie (secţia de reumatologie)
"BIOCARE" (centrul de excelenţă pentru tratamentul afecţiunilor: "poliartrită reumatoidă şi _____artropatie psoriazică") radioterapie (serviciul de radioterapie) anatomie patologică (serviciul de anatomie patologică) blocul operator (blocul operator dermatologic) laboratorul de neuroştiinţe (neuropatologie - cercetare)
medicină nucleară (compartiment de medicină nucleară)
camera de gardă dermatologie (se afla la etajul 2)
În pavilionul F (fost Chirurgie) funcţionează: chirurgie (secţia 1 clinică de chirurgie generală) chirurgie (secţia 2 de chirurgie generală)
chirurgie plastică (compartimentul de chirurgie plastică şi reparatorie)
(A.T.I.) (secţia 2 de anestezie şi terapie intensivă) blocul operator (blocul operator chirurgical)
În pavilionul E (fost Medicala A) funcţionează: cardiologie (secţia de cardiologie)
coronarieni (compartimentul de coronarieni - cardiologie)
diabet şi nutriţie (secţia de diabet & nutriţie şi boli metabolice)
gastroeterologie (secţia de gastroenterologie) medicină internă (secţia 1 de medicină internă) endoscopie-gastroenterologie (compartimentul de endoscopie-gastroenterologie)
endoscopie-chirurgie (compartimentul de endoscopie-chirurgie)
camera de gardă medicina internă (se afla la parter)
În pavilionul H (fost Neurologie) funcţionează: neurologie (secţia 1 de neurologie)
neurologie (secţia 2 de neurologie)
neurologie (secţia 3 de neurologie)
neurologie (A.T.I.) (compartimentul de neurologie terapie intensivă)
camera de gardă neurologie (se afla la parter)
În pavilionul G (fost Ortopedie şi Traumatologie) funcţionează:
ortopedie (secţia 1 de ortopedie şi traumatologie) ortopedie (secţia 2 de ortopedie şi traumatologie) artroscopie (compartimentul de artroscopie)
bancă de ţesuturi (compartimentul bancă de ţesut "os-tendon")
(A.T.I.) (secţia 1 de anestezie şi terapie intensivă) blocul operator (blocul operator ortopedic)
camera de gardă (telefoane de contact - ortopedie gardă)
În pavilionul I (fost Boli Profesionale) funcţionează:
medicina muncii (secţia de medicina muncii "boli profesionale")
farmacia (informaţii despre farmacia cu circuit închis a spitalului)
departamentul de informatică
plasmafereza (cabinetul de plasmafereza)
serviciul de osteodensiometrie
camera de gardă medicina muncii (se afla la parter)
În pavilionul A (fost Camera de Gardă) funcţionează:
recepţii (telefoane de contact - camere de gardă)
În pavilionul D (fost Policlinică) funcţionează: ambulatoriu (cabinetele de specialitate ale ambulatoriului)
T.E.S.A. (conducerea spitalului, biroul de achiziţii electronice, serviciul financiar contabil, biroul de _____
statistică, serviciul R.U.N.O.S., biroul de audit, biroul tehnic şi biroul juridic)
camera de gardă chirurgie (se afla la parter)
În pavilionul J (fost T.E.S.A.) funcţionează:
T.E.S.A. (asistenţa socială şi biroul de inventare) epidemiologie (compartiment epidemiologic)
În pavilionul K (fost Medicala B) funcţionează: Pavilion de Cercetare Medicala
Laboratoare de analize medicale:
Laborator de alergologie şi imunologie
Laborator de bronhoscopie
Laborator de analize medicale
Laborator de E.K.G.
Laborator de electoparaziţi
Laborator de endoscopie
Laborator de explorări funcţionale
Laborator de radiologie
Laborator de recuperare, medicină fizică şi balneologie